В основе сюжетной линии игры содержится вечное противостояние человеческой расы и существ, которые периодически посещают нашу планету, иными словами, космических пришельцев. В этой игре данное противостояние выражено как нельзя ярче и нагляднее. Перед вами в Falling Skies: Planetary War (взломанная версия) стоит непростой выбор, ведь в самом начале игрового процесса необходимо выбрать одну из воюющих «сторон». Присоединившись к людям, либо к пришельцам, вы сразу же определяете свои дальнейшие задачи. Теперь остается одно: сопротивляться всеми существующими способами вторжению инопланетян, либо же организовать войско пришельцев таким образом, чтобы оно наверняка смогло захватить планету людей.